Otomatik kedi tuvaletleri, günlük kum temizleme sürecini kolaylaştıran sistemler arasında yer alır. Ancak sensör, filtre ve hareketli mekanizmalar içerdiği için klasik modellere göre daha dikkatli temizlenmeleri gerekir. Düzenli bakım yapılmadığında kötü koku, algılama sorunları ve mekanik sorunlar ortaya çıkabilir.
Genel temizlik sürecinde cihazın kapatılması, atık haznesinin boşaltılması, çıkarılabilir parçaların temizlenmesi ve elektronik bölümlerin dikkatli şekilde silinmesi gerekir. Tüm parçalar tamamen kuruduktan sonra uygun kum yeniden eklenmeli ve cihaz kontrol edilmelidir.